Sample Job Script - EIC計算機システム

A class †

Single

#!/bin/csh
#$ -jc A
#$ -ac n=1
#$ -ac P=1
#$ -cwd
./a.out

B Class †

Single	OpenMP (8 threads)	MPI (8 processes)
#!/bin/csh #$ -jc B #$ -ac n=8 #$ -ac P=1 #$ -cwd ./a.out	#!/bin/csh #$ -jc B #$ -ac n=8 #$ -ac P=8 #$ -cwd setenv OMP_NUM_THREADS 8 dplace -x2 ./md	#!/bin/csh #$ -jc B #$ -ac n=8 #$ -ac P=8 #$ -cwd mpiexec_mpt -np 8 dplace -s1 ./xhpl

↑

C Class †

OpenMP (32 threads)	MPI (32 processes)	Hybrid 8proc x 4th
#!/bin/csh #$ -jc C #$ -ac n=32 #$ -ac P=32 #$ -cwd setenv OMP_NUM_THREADS 32 dplace -x2 ./md	#!/bin/csh #$ -jc C #$ -ac n=32 #$ -ac P=32 #$ -cwd mpiexec_mpt -np 32 dplace -s1 ./xhpl	#!/bin/csh #$ -jc C #$ -ac n=32 #$ -ac P=32 #$ -cwd setenv OMP_NUM_THREADS 4 mpiexec_mpt -np 8 omplace ./a.out

↑

D Class †

OpenMP (32 threads)	MPI (32 processes)	Hybrid 8proc x 4th
#!/bin/csh #$ -jc D #$ -ac n=32 #$ -ac P=32 #$ -cwd setenv OMP_NUM_THREADS 32 dplace -x2 ./md	#!/bin/csh #$ -jc D #$ -ac n=32 #$ -ac P=32 #$ -cwd mpiexec_mpt -np 32 dplace -s1 ./xhpl	#!/bin/csh #$ -jc D #$ -ac n=32 #$ -ac P=32 #$ -cwd setenv OMP_NUM_THREADS 4 mpiexec_mpt -np 8 omplace ./a.out

↑

E Class †

OpenMP (64 threads)	MPI (64 processes)	Hybrid 8proc x 8th
#!/bin/csh #$ -jc E #$ -ac n=64 #$ -ac P=64 #$ -cwd setenv OMP_NUM_THREADS 64 dplace -x2 ./md	#!/bin/csh #$ -jc E #$ -ac n=64 #$ -ac P=64 #$ -cwd mpiexec_mpt -np 64 dplace -s1 ./xhpl	#!/bin/csh #$ -jc E #$ -ac n=64 #$ -ac P=64 #$ -cwd setenv OMP_NUM_THREADS 8 mpiexec_mpt -np 8 omplace ./a.out

↑

F Class †

OpenMP (64 threads)	MPI (64 processes)	Hybrid 8proc x 8th
#!/bin/csh #$ -jc F #$ -ac n=64 #$ -ac P=64 #$ -cwd setenv OMP_NUM_THREADS 64 dplace -x2 ./md	#!/bin/csh #$ -jc F #$ -ac n=64 #$ -ac P=64 #$ -cwd mpiexec_mpt -np 64 dplace -s1 ./xhpl	#!/bin/csh #$ -jc F #$ -ac n=64 #$ -ac P=64 #$ -cwd setenv OMP_NUM_THREADS 8 mpiexec_mpt -np 8 omplace ./a.out

↑

G Class †

MPI (432 processes)

#!/bin/csh
#$ -jc G
#$ -ac n=432
#$ -ac P=24
#$ -ac T=1
#$ -cwd
mpiexec_mpt -np 432 dplace -s1 ./xhpl

Hybrid 2proc x 12th x 18nodes

#!/bin/csh
#$ -jc G
#$ -ac n=432
#$ -ac P=2
#$ -ac T=12
#$ -cwd
source ${TMP}/hybrid-mpi-$JOB_ID/env.csh
mpiexec_mpt -np $TOTAL_PROCS omplace -nt $OMP_NUM_THREADS ./a.out

↑

H Class †

MPI (432 processes)

#!/bin/csh
#$ -jc H
#$ -ac n=432
#$ -ac P=24
#$ -ac T=1
#$ -cwd
mpiexec_mpt -np 432 dplace -s1 ./xhpl

Hybrid 2proc x 12th x 18nodes

#!/bin/csh
#$ -jc H
#$ -ac n=432
#$ -ac P=2
#$ -ac T=12
#$ -cwd
source ${TMP}/hybrid-mpi-$JOB_ID/env.csh
mpiexec_mpt -np $TOTAL_PROCS omplace -nt $OMP_NUM_THREADS ./a.out